O primeiro aplicativo Android para análise de bandas de géis (agarose e PAGE) com escala logarítmica
*De acordo com as alterações do sistema operacional Android, acesse os arquivos locais usando o ES File Explorer, que fará root na unidade/cartões SD. Você precisará entrar no ES File Explorer para realizar o root primeiro. Observe que o suporte ao Dropbox foi removido devido a alterações no Android e no Dropbox.
Este é o primeiro aplicativo Android que permite analisar bandas de gel (agarose e PAGE) com um gráfico de log gerado automaticamente a partir dos marcadores. Permite detecção e carregamento automáticos para usos futuros. Utilizando o filtro Gabor, este aplicativo permite aos usuários melhorar a detecção de bandas automaticamente. Para imagens de baixa qualidade, os usuários podem clicar em desenhar manualmente uma caixa na banda desejada ou clicar na imagem para determinar o local especificado.
As imagens podem ser carregadas da galeria ou da caixa de depósito, tornando-o muito conveniente. As melhores imagens são aquelas geradas por scanners, mas funcionarão com fotos bem tiradas de câmeras móveis.
As fotos devem ser tiradas em plano direto com o gel.
Os recursos deste aplicativo incluem:
1) Especificação de agarose ou PAGE.
2) Identificação por cores das bandas marcadoras para PAGE.
3) Filtros de imagem avançados - Garbor.
4) Processamento automatizado de imagens com entrada personalizada do usuário, se necessário.
5) Salvar configurações de processamento de imagem para conveniência futura.
6) Salvamento de marcadores para conveniência futura ao usar os mesmos marcadores.
7) Interface de usuário simples e baseada em botões.
8) Detecção automatizada de bandas.
9) Caixa de limite simples definida pelo usuário.
10) Gráfico de registro do marcador gerado automaticamente.
11) Localização definida pelo usuário de bandas específicas.
12) Compatibilidade com visualização paisagem e retrato de tablets e smartphones de vários tamanhos.
13) Compatibilidade com funções de captura de tela de smartphones e tablets de gel analisado e gráfico de log para publicações ou relatórios.
14) Leituras exibidas em imagem de gel com caixas destacadas e tamanho de banda calculado.
15) Função de corte de imagens antes da análise.
16) Função de edição para remover bandas indesejadas.
17) Caixas de cores diferentes para marcadores e faixas.
18) Acesso direto simples à galeria de imagens.
19) Compatível com análise de gel de agarose Sybr Green, EtBr.
20) Acesso direto à câmera.
Benefícios de usar este aplicativo para publicações
1) Traz maior precisão à análise do gel em vez de depender de aproximações.
2) Agrega valor às publicações e relatórios.
3) Ferramenta de ensino útil para estudantes de ciências.
4) Análise simplificada, reduzindo erros humanos e subjetividade – agora você pode confiar nos valores relatados por estagiários e funcionários menos experientes!
5) Análise em movimento com o smartphone/tablet.
6) Análise automatizada - não há necessidade de papel milimetrado e plotagem tediosa.
7) O aplicativo é GRATUITO!
8) O aplicativo é independente, não é necessário acesso à Internet (a menos que seja para análise da caixa de depósito).
Os usuários do Android 6 podem obter imagens da galeria local de "Imagens". Os usuários de versões anteriores do Android terão suporte para DropBox. Isso se deve a alterações no Android 6 e está além do nosso controle.
Para obter instruções de uso, assista ao vídeo em https://www.youtube.com/watch?v=Chlzhy8d_KA&feature=youtu.be
Guia do usuário disponível em PDF em http://tinyurl.com/GelApp
*Os telefones mais recentes, por exemplo, Samsung Note 8, podem ter problemas com o salvamento da câmera. Se houver tais problemas, use a galeria.
Para citar, use:
Sim, JZ.*, Nguyen, PV.*, Lee, HK., Gan, SKE. (2015). GelApp: Analisador móvel de eletroforese em gel. Notas de aplicação de métodos naturais. doi:10.1038/an9643
OU para o software direto na App Store
Sim, JZ, Nguyen, PV, Gan, SKE (2014) Gelapp: DNA&Prot Gel Analyzer v1.2.[Software de aplicação móvel]. Obtido em https://play.google.com
Este aplicativo é um produto do Laboratório de Desenvolvimento de Anticorpos e Produtos, Divisão de Pesquisa Translacional, Instituto de Bioinformática, Agência de Ciência, Tecnologia e Pesquisa, Cingapura.
Os criadores são: Sr. SIM Jia Zhi, Sr. NGUYEN Phi Vu e Dr. Samuel GAN.
(Poliestagiário) (Oficial de Pesquisa) (Investigador Principal Assistente)
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