Die erste Android-App zur Analyse von Gelbändern (Agarose und PAGE) mit Log-Skalierung
*Im Einklang mit den Änderungen des Android-Betriebssystems greifen Sie bitte mit dem ES File Explorer auf lokale Dateien zu, wodurch das Laufwerk/die SD-Karten gerootet werden. Sie müssen zunächst den ES-Datei-Explorer aufrufen, um das Rooten durchzuführen. Bitte beachten Sie, dass die Dropbox-Unterstützung aufgrund von Änderungen in Android und Dropbox entfernt wurde.
Dies ist die erste Android-App, mit der Sie Gelbanden (sowohl Agarose als auch PAGE) mit einem automatisch aus den Markern generierten Protokolldiagramm analysieren können. Es ermöglicht die automatische Erkennung und das Laden für zukünftige Verwendungen. Mithilfe des Gabor-Filters können Benutzer mit dieser App die Erkennung von Bändern automatisch verbessern. Bei Bildern mit schlechter Qualität können Benutzer manuell ein Kästchen auf dem gewünschten Band zeichnen oder auf das Bild klicken, um die angegebene Position zu bestimmen.
Bilder können aus der Galerie oder Dropbox geladen werden, was es sehr praktisch macht. Die besten Bilder werden von Scannern erzeugt, funktionieren aber auch mit gut aufgenommenen Fotos von mobilen Kameras.
Fotos sollten direkt mit dem Gel aufgenommen werden.
Zu den Funktionen dieser App gehören:
1) Angabe von Agarose oder PAGE.
2) Farbidentifizierung der Markierungsbänder für PAGE.
3) Erweiterte Bildfilter – Garbor.
4) Automatisierte Bildverarbeitung mit individueller Benutzereingabe, falls erforderlich.
5) Speichern der Einstellungen für die Bildverarbeitung für zukünftige Bequemlichkeit.
6) Speichern von Markern für die zukünftige Verwendung derselben Marker.
7) Einfache und tastenbasierte Benutzeroberfläche.
8) Automatisierte Erkennung von Banden.
9) Einfaches benutzerdefiniertes Begrenzungsfeld.
10) Protokolldiagramm der automatisch generierten Markierung.
11) Benutzerdefinierter Standort bestimmter Bänder.
12) Kompatibilität mit der Quer- und Hochformatansicht von Tablets und Smartphones unterschiedlicher Größe.
13) Kompatibilität mit Screenshot-Funktionen analysierter Gel- und Log-Graph-Smartphones und Tablets für Veröffentlichungen oder Berichte.
14) Im Gelbild angezeigte Messwerte mit hervorgehobenen Kästchen und berechneter Bandengröße.
15) Zuschneidefunktion für Bilder vor der Analyse.
16) Bearbeitungsfunktion zum Entfernen unerwünschter Bänder.
17) Verschiedenfarbige Kästchen für Marker und Bänder.
18) Einfacher direkter Zugriff auf die Bildergalerie für Bilder.
19) Kompatibel mit Sybr Green, EtBr-Agarose-Gelanalyse.
20) Direkter Kamerazugriff.
Vorteile der Verwendung dieser App für Veröffentlichungen
1) Erhöht die Genauigkeit Ihrer Gelanalyse, anstatt sich auf Näherungen zu verlassen.
2) Mehrwert für Veröffentlichungen und Berichte.
3) Nützliches Lehrmittel für Studenten der Naturwissenschaften.
4) Optimierte Analyse, Reduzierung menschlicher Fehler und Subjektivität – Sie können jetzt den Werten vertrauen, die von Auszubildenden und weniger erfahrenen Mitarbeitern gemeldet werden!
5) Analyse unterwegs mit dem Smartphone/Tablet.
6) Automatisierte Analyse – kein Millimeterpapier und mühsames Plotten erforderlich.
7) Die App ist KOSTENLOS!
8) Die App ist eigenständig, es ist kein Internetzugang erforderlich (außer für die Dropbox-Analyse).
Benutzer von Android 6 können Bilder aus der lokalen „Bilder“-Galerie abrufen. Benutzer früherer Android-Versionen werden DropBox unterstützen. Dies ist auf Änderungen in Android 6 zurückzuführen und liegt außerhalb unserer Kontrolle.
Anweisungen zur Verwendung finden Sie im Video unter https://www.youtube.com/watch?v=Chlzhy8d_KA&feature=youtu.be
Benutzerhandbuch als PDF verfügbar unter http://tinyurl.com/GelApp
*Neueste Telefone, z. B. Samsung Note 8, können Probleme beim Speichern der Kamera haben. Wenn es solche Probleme gibt, verwenden Sie die Galerie.
Zum Zitieren verwenden Sie bitte:
Sim, JZ.*, Nguyen, PV.*, Lee, HK., Gan, SKE. (2015). GelApp: Mobiler Gelelektrophorese-Analysator. Anwendungshinweise zu Nature Methods. doi:10.1038/an9643
ODER zur Software direkt im App Store
Sim, JZ, Nguyen, PV, Gan, SKE (2014) Gelapp: DNA&Prot Gel Analyzer v1.2.[Mobile Anwendungssoftware]. Abgerufen von https://play.google.com
Diese App ist ein Produkt des Antibody & Product Development Lab, Translational Research Division, Bioinformatics Institute, Agency for Science, Technology, and Research, Singapur.
Schöpfer sind: Herr SIM Jia Zhi, Herr NGUYEN Phi Vu und Dr. Samuel GAN.
(Poly-Praktikant) (Forschungsbeauftragter) (Stellvertretender Hauptermittler)
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