La primera aplicación de Android para analizar bandas de geles (agarosa y PAGE) con escalado logarítmico
*De acuerdo con los cambios del sistema operativo Android, acceda a los archivos locales utilizando ES File Explorer, que rooteará la unidad/las tarjetas SD. Primero deberá ingresar al Explorador de archivos ES para realizar el enraizamiento. Tenga en cuenta que la compatibilidad con Dropbox se elimina debido a cambios en Android y Dropbox.
Esta es la primera aplicación de Android que le permite analizar bandas de gel (tanto de agarosa como de PAGE) con un gráfico de registro generado automáticamente a partir de los marcadores. Permite la detección y carga automática para usos futuros. Utilizando el filtro Gabor, esta aplicación permite a los usuarios mejorar la detección de bandas automáticamente. Para imágenes de mala calidad, los usuarios pueden hacer clic para dibujar manualmente un cuadro en la banda deseada o hacer clic en la imagen para determinar la ubicación especificada.
Las imágenes se pueden cargar desde la galería o Dropbox, lo que lo hace muy conveniente. Las mejores imágenes son las generadas a través de escáneres, pero funcionarán con fotografías bien tomadas con las cámaras del móvil.
Las fotografías deben tomarse en plano directo con el gel.
Las características de esta aplicación incluyen:
1) Especificación de agarosa o PAGE.
2) Identificación de color de las bandas marcadoras para PÁGINA.
3) Filtros de imágenes avanzados: Garbor.
4) Procesamiento de imágenes automatizado con entrada de usuario personalizada si es necesario.
5) Guardar la configuración para el procesamiento de imágenes para mayor comodidad en el futuro.
6) Guardar marcadores para mayor comodidad al utilizar los mismos marcadores.
7) Interfaz de usuario sencilla y basada en botones.
8) Detección automatizada de bandas.
9) Cuadro de límite simple definido por el usuario.
10) Gráfico de registro del marcador generado automáticamente.
11) Ubicación definida por el usuario de bandas específicas.
12) Compatibilidad con vista horizontal y vertical de tabletas y teléfonos inteligentes de varios tamaños.
13) Compatibilidad con funciones de captura de pantalla de geles analizados y teléfonos inteligentes y tabletas con gráficos de registro para publicaciones o informes.
14) Lecturas mostradas en imagen de gel con cuadros resaltados y tamaño de banda calculado.
15) Función de recorte de imágenes antes del análisis.
16) Función de edición para eliminar bandas no deseadas.
17) Cajas de diferentes colores para marcadores y bandas.
18) Acceso directo simple a la galería de imágenes para imágenes.
19) Compatible con Sybr Green, análisis en gel de agarosa EtBr.
20) Acceso directo a la cámara.
Beneficios de usar esta aplicación para publicaciones
1) Aporta mayor precisión a su análisis de gel en lugar de depender de aproximaciones.
2) Valor agregado a publicaciones e informes.
3) Herramienta didáctica útil para estudiantes de ciencias.
4) Análisis optimizado, que reduce el error humano y la subjetividad: ¡ahora puede confiar en los valores informados por los alumnos y el personal menos experimentado!
5) Análisis sobre la marcha con el teléfono inteligente/tableta.
6) Análisis automatizado: no es necesario utilizar papel cuadriculado ni tediosos trazados.
7) ¡La aplicación es GRATIS!
8) La aplicación es autónoma, no se necesita acceso a Internet (a menos que sea para análisis de Dropbox).
Los usuarios de Android 6 pueden obtener imágenes de la galería de "Imagen" local. Los usuarios de versiones anteriores de Android tendrán soporte para DropBox. Esto se debe a cambios en Android 6 y está fuera de nuestro control.
Para obtener instrucciones de uso, mire el video en https://www.youtube.com/watch?v=Chlzhy8d_KA&feature=youtu.be
Guía del usuario disponible en formato pdf en http://tinyurl.com/GelApp
*Los teléfonos más recientes, por ejemplo Samsung Note 8, pueden tener problemas para guardar la cámara. Si existen tales problemas, utilice la galería.
Para citar utilice:
Sim, JZ.*, Nguyen, PV.*, Lee, HK., Gan, SKE. (2015). GelApp: Analizador de electroforesis en gel móvil. Notas de aplicación de métodos naturales. doi:10.1038/an9643
O al software directamente en la App Store
Sim, JZ, Nguyen, PV, Gan, SKE (2014) Gelapp: DNA&Prot Gel Analyzer v1.2.[Software de aplicación móvil]. Obtenido de https://play.google.com
Esta aplicación es un producto del Laboratorio de Desarrollo de Productos y Anticuerpos, División de Investigación Traslacional, Instituto de Bioinformática, Agencia de Ciencia, Tecnología e Investigación de Singapur.
Los creadores son: SIM Jia Zhi, NGUYEN Phi Vu y Dr. Samuel GAN.
(Pasante de Poly) (Oficial de investigación) (Investigador principal asistente)
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