La 1ère application Android pour analyser les bandes de gels (agarose et PAGE) avec log scaling
*Conformément aux modifications du système d'exploitation Android, veuillez accéder aux fichiers locaux à l'aide de ES File Explorer, qui rootera le lecteur/les cartes SD. Vous devrez d'abord accéder à ES File Explorer pour effectuer l'enracinement. Veuillez noter que la prise en charge de Dropbox est supprimée en raison de modifications apportées à Android et Dropbox.
Il s'agit de la première application Android qui vous permet d'analyser les bandes de gel (agarose et PAGE) avec un graphique journal généré automatiquement à partir des marqueurs. Il permet une détection et un chargement automatiques pour des utilisations futures. Utilisant le filtre Gabor, cette application permet aux utilisateurs d'améliorer automatiquement la détection des bandes. Pour les images de mauvaise qualité, les utilisateurs peuvent cliquer pour dessiner manuellement un cadre sur la bande souhaitée ou cliquer sur l'image pour déterminer l'emplacement spécifié.
Les images peuvent être chargées depuis une galerie ou une boîte de dépôt, ce qui est très pratique. Les meilleures images sont celles générées par les scanners, mais fonctionneront avec des photos bien prises par les appareils photo mobiles.
Les photos doivent être prises en avion direct avec le gel.
Les fonctionnalités de cette application incluent :
1) Spécification de l'agarose ou du PAGE.
2) Identification par couleur des bandes de marquage pour PAGE.
3) Filtres d'imagerie avancés - Garbor.
4) Traitement d'image automatisé avec entrée utilisateur personnalisée si nécessaire.
5) Sauvegarde des paramètres de traitement d'image pour plus de commodité future.
6) Sauvegarde des marqueurs pour plus de commodité lors de l'utilisation des mêmes marqueurs.
7) Interface utilisateur simple et basée sur des boutons.
8) Détection automatisée des bandes.
9) Boîte de délimitation simple définie par l'utilisateur.
10) Graphique du journal du marqueur généré automatiquement.
11) Emplacement défini par l'utilisateur de bandes spécifiques.
12) Compatibilité avec les vues paysage et portrait de tablettes et de smartphones de plusieurs tailles.
13) Compatibilité avec les fonctions de capture d'écran des smartphones et tablettes analysés sur gel et graphique de journal pour des publications ou des rapports.
14) Lectures affichées dans l'image du gel avec des cases en surbrillance et la taille de bande calculée.
15) Fonction de recadrage des images avant analyse.
16) Fonction d'édition pour supprimer les bandes indésirables.
17) Boîtes de différentes couleurs pour les marqueurs et les bandes.
18) Accès direct simple à la galerie d'images pour les images.
19) Compatible avec l'analyse sur gel d'agarose Sybr Green, EtBr.
20) Accès direct à la caméra.
Avantages de l'utilisation de cette application pour les publications
1) Apporte une plus grande précision à votre analyse de gel au lieu de s'appuyer sur des approximations.
2) Valeur ajoutée aux publications et aux rapports.
3) Outil pédagogique utile pour les étudiants en sciences.
4) Analyse rationalisée, réduisant les erreurs humaines et la subjectivité - vous pouvez désormais faire confiance aux valeurs rapportées par les stagiaires et le personnel moins expérimenté !
5) Analyse en déplacement avec le smartphone/tablette.
6) Analyse automatisée – pas besoin de papier millimétré ni de traçage fastidieux.
7) L'application est GRATUITE !
8) L'application est autonome, aucun accès Internet n'est nécessaire (sauf pour l'analyse de la boîte de dépôt).
Les utilisateurs d'Android 6 peuvent obtenir des images à partir de la galerie "Image" locale. Les utilisateurs des versions antérieures d'Android bénéficieront de la prise en charge de DropBox. Cela est dû aux changements apportés à Android 6 et échappe à notre contrôle.
Pour les instructions d'utilisation, veuillez regarder la vidéo sur https://www.youtube.com/watch?v=Chlzhy8d_KA&feature=youtu.be
Guide de l'utilisateur disponible au format PDF sur http://tinyurl.com/GelApp
*Les derniers téléphones, par exemple le Samsung Note 8, peuvent rencontrer des problèmes avec l'enregistrement de l'appareil photo. S'il y a de tels problèmes, utilisez la galerie.
Pour citer, veuillez utiliser :
Sim, JZ.*, Nguyen, PV.*, Lee, HK., Gan, SKE. (2015). GelApp : Analyseur d'électrophorèse sur gel mobile. Notes d’application des méthodes naturelles. est ce que je:10.1038/an9643
OU au logiciel directement dans l'App Store
Sim, JZ, Nguyen, PV, Gan, SKE (2014) Gelapp : DNA&Prot Gel Analyzer v1.2. [Logiciel d'application mobile]. Extrait de https://play.google.com
Cette application est un produit du laboratoire de développement d'anticorps et de produits, division de recherche translationnelle, institut de bioinformatique, agence pour la science, la technologie et la recherche, Singapour.
Les créateurs sont : M. SIM Jia Zhi, M. NGUYEN Phi Vu et Dr Samuel GAN.
(Stagiaire poly) (Agent de recherche) (Chercheur principal adjoint)
En savoir plus
