Aplikasi android pertama untuk menganalisis pita gel (agarose dan PAGE) dengan penskalaan log
*Sejalan dengan perubahan OS Android, silakan akses file lokal menggunakan ES File Explorer, yang akan melakukan root pada drive/kartu SD. Anda harus masuk ke ES File Explorer untuk melakukan rooting terlebih dahulu. Harap dicatat bahwa dukungan Dropbox dihapus karena perubahan di Android dan Dropbox.
Ini adalah aplikasi android pertama yang memungkinkan Anda menganalisis pita gel (agarosa dan PAGE) dengan grafik log yang dihasilkan secara otomatis dari penanda. Ini memungkinkan deteksi dan pemuatan otomatis untuk penggunaan di masa mendatang. Memanfaatkan filter Gabor, aplikasi ini memungkinkan pengguna meningkatkan deteksi pita secara otomatis. Untuk gambar berkualitas buruk, pengguna dapat mengklik secara manual menggambar kotak pada pita yang diinginkan atau mengklik gambar untuk menentukan lokasi yang ditentukan.
Gambar dapat dimuat dari galeri atau dropbox, sehingga sangat nyaman. Gambar terbaik dihasilkan melalui pemindai, namun akan berfungsi dengan foto yang diambil dengan baik dari kamera ponsel.
Foto harus diambil pada bidang langsung dengan gel.
Fitur aplikasi ini meliputi:
1) Spesifikasi agarosa atau PAGE.
2) Identifikasi warna pita penanda untuk PAGE.
3) Filter pencitraan tingkat lanjut - Garbor.
4) Pemrosesan gambar otomatis dengan input pengguna yang disesuaikan jika perlu.
5) Menyimpan pengaturan pemrosesan gambar untuk kenyamanan masa depan.
6) Menyimpan spidol untuk kenyamanan di masa depan ketika menggunakan spidol yang sama.
7) Antarmuka pengguna yang sederhana dan berbasis tombol.
8) Deteksi pita secara otomatis.
9) Kotak batas sederhana yang ditentukan pengguna.
10) Grafik log penanda dihasilkan secara otomatis.
11) Lokasi band tertentu yang ditentukan pengguna.
12) Kompatibilitas dengan tampilan lanskap dan potret berbagai ukuran tablet dan ponsel pintar.
13) Kompatibilitas dengan fungsi tangkapan layar dari smartphone dan tablet grafik gel dan log yang dianalisis untuk publikasi atau laporan.
14) Pembacaan ditampilkan dalam gambar gel dengan kotak yang disorot dan ukuran pita yang dihitung.
15) Fungsi pemotongan gambar sebelum dianalisis.
16) Edit fungsi untuk menghapus band yang tidak diinginkan.
17) Kotak berwarna berbeda untuk spidol dan pita.
18) Akses langsung sederhana ke Galeri gambar untuk gambar.
19) Kompatibel dengan analisis gel agarosa Sybr Green, EtBr.
20) Akses kamera langsung.
Manfaat menggunakan aplikasi ini untuk publikasi
1) Memberikan akurasi yang lebih baik pada analisis gel Anda daripada mengandalkan perkiraan.
2) Nilai tambah pada publikasi dan laporan.
3) Alat pengajaran yang berguna bagi siswa sains.
4) Analisis yang disederhanakan, mengurangi kesalahan manusia dan subjektivitas - kini Anda dapat mempercayai nilai-nilai yang dilaporkan oleh peserta pelatihan dan staf yang kurang berpengalaman!
5) Analisis saat bepergian dengan smartphone/tablet.
6) Analisis otomatis - tidak memerlukan kertas grafik dan pembuatan plot yang membosankan.
7) Aplikasi ini GRATIS!
8) Aplikasi ini mandiri, tidak memerlukan akses internet (kecuali untuk analisis dropbox).
Pengguna Android 6 bisa mendapatkan gambar dari galeri "Gambar" lokal. Pengguna versi Android sebelumnya akan mendapat dukungan untuk DropBox. Hal ini disebabkan oleh perubahan pada Android 6, dan berada di luar kendali kami.
Untuk petunjuk penggunaan, silakan tonton video di https://www.youtube.com/watch?v=Chlzhy8d_KA&feature=youtu.be
Panduan pengguna tersedia dalam bentuk pdf di http://tinyurl.com/GelApp
*Ponsel terbaru misalnya Samsung Note 8 mungkin mengalami masalah dengan penyimpanan kamera. Jika ada masalah seperti itu, gunakan galeri.
Untuk mengutip, silakan gunakan:
Sim, JZ.*, Nguyen, PV.*, Lee, HK., Gan, SKE. (2015). GelApp: Penganalisis elektroforesis gel seluler. Catatan Penerapan Metode Alam. doi:10.1038/an9643
ATAU ke perangkat lunak langsung di App store
Sim, JZ, Nguyen, PV, Gan, SKE (2014) Gelapp: DNA&Prot Gel Analyzer v1.2.[Perangkat Lunak Aplikasi Seluler]. Diperoleh dari https://play.google.com
Aplikasi ini merupakan produk dari Lab Pengembangan Antibodi & Produk, Divisi Penelitian Translasional, Institut Bioinformatika, Badan Sains, Teknologi, dan Penelitian, Singapura.
Penciptanya adalah: Tuan SIM Jia Zhi, Tuan NGUYEN Phi Vu, dan Dr Samuel GAN.
(Magang poli) (Petugas Peneliti) (Asisten Penyidik Kepala)
Baca selengkapnya
